Dos monitores conectados a un ordenador con su resolución nativa.

Si por ejemplo conectas un monitor de 1920 x 1080 a un portátil que tiene 1366 x 768 y duplicas o clonas el escritorio, el monitor solo tendrá 1366 x 768 pixels. La única forma de conseguir que el monitor trabaje a 1920 x 1080 (que yo sepa) es usar la configuración de pantallas en la forma "escritorio extendido",  de esta forma Windows te deja escoger una definición para cada pantalla y por tanto usar las que mejor te convengan. En el escritorio extendido se puede llevar la aplicación que quieras arrastrándola con el ratón a cualquiera de la pantallas.